MfIP会員総会
機関会員の代表者で構成し、概ね年1～2回程度開催する。
MfIPの事業および運営に係る事項について審議する。
MfIP運営委員会
MfIP会議で指名された者で構成し、年数回程度開催する。
MfIP会員総会での審議事項の審議や、年次報告書の作成、その他のMfIP活動に関わる内容について審議する。
MfIP実務担当者連絡会議
機関会員の実務担当者によって構成し、年数回程度開催する。
MfIP会員総会および運営委員会での決定事項等に関する情報共有や実務執行を行う。
MfIPアドバイザリー委員会
運営委員会が指名する、諸科学・産業界・数学関連学会等の外部有識者で構成し、年1〜2回程度開催する。
年次報告書およびMfIP事務局からの報告等に基づき、MfIPの事業活動に係る助言を行う。